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以全基因轉錄組和蛋白​​質體分析來鑑定驗證頭頸部鱗狀上皮細胞癌的生物標記

為了解決Seth Curry NBA的問題，作者祁力行 這樣論述：

頭頸部鱗狀上皮細胞癌(以下稱為 HNSCC) 在全球都是重要的健康問題之一。手術、放射、以及化學治療目前是HNSCC 患者的標準治療。病患的存活必須仰賴: 1)足夠(大)的手術切緣、病理報告指引的放射治療，2)系統性治療(標靶、免疫療法)的「生物標記」，以及3)全人癌症照護(顧及靈性須求、身體照護、心理支持，與社會支援)。HNSCC癌症存活分析在傳統上，是利用組織中基因表現量的差異(DEGs)，以臨床資訊搭配蛋白質體的數據，來找尋生物標記。而採用HNSCC全基因表現量、結合存活分析的方法，則首見於2021年發表的「pvalueTex」。本文介紹質譜法分析HNSCC，以及pvalueTex的處

理流程，包括數據檢索、前製處理、特徵選擇、「無段式」閾值分析、Kaplan--Meier存活分析，和Cox比例風險模型。我們依此發現，HNSCC的獨立預後因子為: 生物標記（TMSB4X、CAMK2N1、CALML5 和FCGBP）、腫瘤大小，以及手術切緣狀態。由總存活期 (OS) 、無復發存活期(RFS)較差的的患者檢體中，可以發現大量表現的TMSB4X蛋白。實驗中發現，若抑制HNSCC細胞株中的TMSB4X，其細胞增殖速率會減少，且降低小鼠的頸部淋巴結轉移，證明TMSB4X與HNSCC的頸部轉移有高度相關。至於CAMK2N1、CALML5和FCGBP基因的表現量，則與患者的總存活期(OS)

密切相關。我們必須推廣全人癌症照護的觀念，強調靈性、精神、情感、身體和社會關係層面，對癌症患者存活的重要影響。全人癌症照護結合有效的生物標記，終將成為真正量身定製的個人化治療。